大英博物館に持ち込まれた楔形文字の小さな石板。そこには古代バビロニアの大洪水と巨大な船の作り方が書かれていた。しかもそれは創世記の「ノアの箱舟」伝説とは全く異なるものだった。メソポタミアの洪水伝説が旧約聖書に組み込まれていく過程をたどるうちに、ノアの箱舟の驚くべき形が明らかになる。

考古学者デイララ・ケナーは、旧友のサムから連絡を受け、彼女の行方不明の父親に関する重大な情報を得たと言われる。発掘現場を早々に引き上げた彼女は、サムと会うべくロサンゼルスに舞い戻った。しかし、ロスの空港で彼が口にしたのは、父自身のことではなく、父がライフワークとして長年探し求めてきた“ノアの方舟”と、それによって莫大な数の人間が死ぬ可能性があるという衝撃の事実だった。そして、タイラー・ロックを探せと言い残して息絶えてしまう。ディララは、元陸軍兵だったタイラーの居場所を突き止め、協力を求める。“ノアの方舟”の謎とは？そして、人類の文明を壊滅させようと企む、カルト集団の計画とは？真相に近づきはじめた２人に残された時間は、たったの７日だった…。

「ノアの箱舟」は実在するのか…？聖書考古学者マーフィーのもとに謎の老人メトセラから、不思議なメッセージが届いた。そのメッセージに導かれ、マーフィーが手に入れた、瀝青を塗った小さな木片が五千年前のものだと判明する。それはどうやら、「ノアの箱舟」の一部分であるらしい…。老人はこのメッセージを通して何を告げようとしているのか？相前後して、マーフィーの周囲では奇怪な出来事が続発する。マーフィーはトルコの秘境アララト山に向かおうとするが…。